皮卡丘和它的伙伴们因为一次意外流落到无人岛，在回到小智身边之前，它们必须学会独自生存。
暑假到了，小智和皮卡丘乘船前往宝可梦度假村。一阵突如其来的暴风雨将皮卡丘、伊布、可达鸭、杰尼龟和妙蛙种子吹到了一个地图上不存在的岛屿。这里没有训练家，没有精灵球，只有茂密的丛林和古老的遗迹。皮卡丘的十万伏特在岛上莫名其妙的失灵了。它们必须合作寻找食物、水源，并提防岛上凶猛的野生宝可梦。在探索遗迹的过程中，它们发现这座岛其实是古代宝可梦的墓地，而让皮卡丘失去电力的，是一块净化之石。伊布面临进化抉择，可达鸭突然展现预知能力。当救援队赶到时，皮卡丘却面临着选择：恢复电力召唤小智，还是让这座与世隔绝的宝可梦天堂继续存在？
这是献给成年观众的宝可梦童话。在没有人类的环境里，宝可梦的角色性格被放大得无比可爱。画面美到每一帧都可以做壁纸，尤其是夏夜萤火虫与宝可梦共舞的场景。故事内核关于独立与分别，非常治愈又略带伤感，最后的眼泪是甜的。
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